1963年 耶穌孝女會安秀貞修女(Sr.Angeles de Dios,F.I)與費濟時蒙席(Msgr.Eugene Fahy,S.J)決定籌款建堂。
1964年3月的一個主日，第一台感恩禮在日式老屋舉行，由費濟時蒙席主持新聖堂破土典禮。
1970年至1972年，聖威廉堂負責全院伙食(公炊制度)。
1975年耶穌會谷寒松神父(Fr.Luis Gutheinz,S.J)到職，擔任副本堂神父。
1994年11月谷寒松神父、基督長老聖望教會林昌華牧師、佛教金義禎居士，同聲建議北市捷運局，對樂生土地做妥當合理規劃。
1998年4月9日 聖週四為病友「洗手」，因為洗腳為漢生病友們不方便。
2004年3月7日左仙林(纇思)先生，擔任過三十年的樂生天主教團體代表，如今在天鄉永享福樂。
2004年10月17日陳銀露(若瑟)弟兄，信仰的模範，進入他所渴望的永生！
2005年7月20日，樂生療養院新廈落成，谷神父帶 領與會人員祈禱，並灑聖水祝福療養院新址。
2005年10月9日主日彌撒後，大家回顧在舊聖堂生活點滴。
將舊聖堂所有的聖物器皿、風琴、歌本等等，全都搬到貨車上，移置聖堂新址。
2005年10月16日主日上午10點，在迴龍醫院B棟9樓聖堂新址，慶祝建堂40週年暨奉獻新聖堂感恩祭典，由鄭再發總主教主禮。
谷神父為參禮的來賓們致詞並介紹迴龍聖威廉天主堂的過去、現在與未來。
2013年7月1日台北總教區洪山川總主教,發佈本堂升格為準堂區(原隸屬新莊聖保祿堂分堂)
2014年7月23日洪總主教發佈人事令,派遣耶穌聖心金邦尼傳教會士施立哲神父擔任本堂第一任主任司鐸,至此本堂正式隸屬台北教區第六鐸區。
